从筛选的菌株中成功克隆出Inu1、Inu2两个外切菊粉酶基因：Inu1（MW355866）包含一个1482 bp的开放阅读框，可编码493个氨基酸；Inu2（MW355867）基因序列中有一个2616 bp的开放阅读框，编码871个氨基酸。将Inu1/2基因分别转化至毕赤酵母中，经过甲醇诱导表达出重组菊粉酶INU1/2。INU1在发酵培养24小时后显示出0.32 U/mL的菊粉酶活性，INU2的酶活性在培养36小时后达到峰值，可达6.15 U/mL。对重组菊粉酶进行了SDS-PAGE分析，纯化的INU1分子量约为59.0 kDa，纯化的INU2分子量约为100 kDa，均与其预测分子量相符，这也验证了重组蛋白INU1和INU2的成功表达。
纯化的重组菊粉酶INU1在pH为6，30 ℃的条件下水解菊粉的能力最高，达到0.45 U/mg，添加1 mM MgSO4·5H2O 的处理组与未添加金属离子的对照组酶活相比提升了约10 %，Cu2+ 和 Fe3+使INU1完全失活。纯化的重组菊粉酶INU2在pH为6, 45 ℃的条件下水解菊粉的能力最高，达到46.3 U/mg，添加1 mM LiCl对INU2酶活的促进作用最大，其活性与未添加金属离子的对照相比增加近20 %，Fe2+、Zn2+、Cu2+和Fe3+对INU2酶活起抑制作用。纯化的重组菊粉酶INU1和INU2均能水解利云型果聚糖和菊粉，在水解短链菊糖分子时，INU1似乎具有较强的水解活性，而在水解长链菊糖分子时水解能力较低。INU2对于长短链菊糖分子的水解能力与INU1相反，这一结果可能表明INU1与INU2对菊粉水解具有一定协同作用。